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El gusano que ningún científico informático puede descifrar

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El gusano que ningún científico informático puede descifrar
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El Santa Ana Los vientos ya soplaban con fuerza cuando corrí la primera simulación de gusanos. No soy un hacker, pero fue bastante fácil: abrir una carcasa terminal, pegar algunos comandos de GitHub, ver personajes en cascada en la pantalla. Al igual que en las películas. Estaba escaneando el código de paso para palabras reconociblesneurona, sinapsis—Cuando un amigo vino a recogerme para cenar. “Un segundo”, grité desde mi oficina. “Solo estoy ejecutando un gusano en mi computadora”.

En el restaurante coreano, la energía era maníaca; El viento estaba doblando las palmeras en la cintura y enviando carros de compras patinando a través del estacionamiento. La atmósfera se sintió aumentada e irreal, como un podcast a doble velocidad. Estás haciendo, ¿qué, un delito cibernético? Preguntó mi amigo. Sobre el estruendo, intenté explicar: No, no un gusano como Stuxnet. Un gusano como Richard Scarry.

Cuando llegué a casa estaba oscuro, y las primeras chispas ya habían aterrizado en Altadena. En mi computadora portátil, esperándome en una caja de píxeles volumétricas, estaba el gusano. Señalado en cada extremo, flotó en una niebla de partículas, misteriosamente consecutivas e inmóviles. Por supuesto, no estaba vivo. Aún así, me pareció más muerto que muerto. “Bravo”, dijo Stephen Larson, cuando lo contacté más tarde esa noche. “Has logrado el estado ‘Hello World’ de la simulación”.

Larson es un cofundador de Gusano abiertoun esfuerzo de software de código abierto que ha estado intentando, desde 2011, construir una simulación por computadora de un nematodo microscópico llamado Caenorhabditis elegans. Su objetivo es nada menos que un gemelo digital del verdadero gusano, preciso hasta la molécula. Si Openworm puede manejar esto, sería el primer animal virtual, y una encarnación de todo nuestro conocimiento no solo sobre C. elegansque es uno de los animales más estudiados de la ciencia, pero sobre cómo los cerebros interactúan con el mundo para producir comportamiento: el “santo grial”, como lo expresa el gusano abierto, de la biología de sistemas.

Desafortunadamente, no lo han logrado. La simulación en mi computadora portátil toma los datos seleccionados de los experimentos realizados con gusanos vivos y lo traduce en un marco computacional llamado C302, que luego impulsa la musculatura simulada de un C. elegans gusano en un entorno dinámico fluido, todo, en total, una simulación de cómo un gusano se estrella hacia adelante en una placa plana de Goo. Se necesitan un tiempo de cómputo para generar cinco segundos de este comportamiento.

Tanto puede suceder en 10 horas. Una Embber puede viajar en el viento, desde las estribaciones y hasta la ciudad dormida. Esa noche, por consejo de Larson, modifiqué los parámetros de tiempo de la simulación, empujando más allá del “mundo de hola” y más profundamente en el extraño valle del gusano. A la mañana siguiente, me desperté con una espeluznante neblina naranja, y cuando abrí mi computadora portátil, con los ojos nublados, dos cosas hicieron que mi corazón se saltara: Los Ángeles estaba en llamas. Y mi gusano se había movido.

En este punto, Es posible que se haga una pregunta muy razonable. De vuelta en el lugar coreano, entre Bites of Banchan, mi amigo también lo había preguntado. La pregunta es esta: Uhh … ¿por qué? ¿Por qué, frente a todo lo que perdura nuestro precario mundo verde, de todos los problemas para resolver, alguien pasaría 13 años tratando de codificar un gusano microscópico en la existencia?

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